Ох, недавно намучался я с такой проблемой. Кое как удалось смонтировать видео
HA[CCCP] vs Беркуты 30.09.2012. Vegas не в какую не хотел рендерить видео со звуком 5.1, просто вылетал с ошибкой. Пришлось сначала вытащить звук из видео, перекодировав его в стерео. Видео тоже кодировал без звука. Потом в Vegas вставлял отдельно видео и звук. Но опять вылеты Vegas'а не исчезли, нашёл выход - получалось рендерить небольшими кусками. Потом эти куски собрал в один файл. Вроде получилось более мене сносно, но ***тский youtube посчитал себя умнее всех и отрендерил видео еще раз, теперь как-то странно экран ползает по всему видео.
Для всех манипуляций со звуком и видео использовал VirtualDub.